Nachdem eine eingehende SMTP-Verbindung hergestellt wurde, durchläuft MDaemon einen komplexen Prozess, um festzustellen, ob die Nachricht zur Zustellung angenommen werden kann, und wie sie danach weiterzuverarbeiten ist. Die folgende Übersicht soll diesen Arbeitsablauf bei eingehenden SMTP-Verbindungen grafisch darstellen.

Ob alle dargestellten Schritte im Einzelfall auch durchlaufen werden, hängt von der genauen Konfiguration des jeweils verwendeten Systems ab. Sind in der Konfiguration einzelne Funktionen abgeschaltet, so werden u.U. Schritte übersprungen.